O uso mais comum da E2EE é para comunicações seguras em serviços de mensagens móveis e online. Esses aplicativos de mensagens usam E2EE para garantir que apenas o remetente e o destinatário possam ler as mensagens, e não os prestadores de serviços.
O iMessage da Apple usa E2EE para proteger mensagens enviadas entre iPhones e outros dispositivos Apple, tornando a leitura das mensagens impossível para qualquer pessoa, inclusive para a Apple.
No caso do Android existem mais variações. O próprio Android não impõe a E2EE para todos os aplicativos de mensagens, em vez disso, deixa a critério individual dos desenvolvedores de aplicativos. No entanto, muitos aplicativos de mensagens na Google Play Store oferecem E2EE.
Por exemplo, o WhatsApp, de propriedade da Meta, emprega E2EE para todas as mensagens e chamadas, garantindo que mesmo o provedor de serviços não possa acessar o conteúdo das comunicações. O Signal é conhecido por sua ênfase rigorosa em privacidade e segurança. Oferece E2EE por padrão para todas as comunicações, incluindo mensagens, chamadas e chats de vídeo.
Os sistemas de e-mail também podem usar criptografia de ponta a ponta, o que geralmente requer a configuração de criptografia PGP (Pretty Good Privacy). O PGP é um programa de criptografia e descriptografia de dados que protege o conteúdo das mensagens e autentica os remetentes, evitando adulterações.
Alguns serviços de e-mail, como o Proton Mail, têm suporte integrado para PGP, simplificando o processo para os usuários. Outros serviços, como o Tuta, oferecem seus próprios métodos de criptografia de ponta a ponta.