Anacondaリポジトリのライブラリを使用する

Anaconda Repository for IBM Cloud Pak for Data のソフトウェアパッケージやライブラリは、 RStudio で利用できます。

Anaconda Repository for IBM Cloud Pak for Data サービスは、 デフォルトでは利用できません。 このサービスは、管理者によってインストールされる必要があります。

RStudio で Anaconda Repository のパッケージやライブラリを使用するには:

  1. condaチャンネルの作成、パッケージのミラーリング、および設定を行います。 「conda の設定とチャネルの作成 」を参照してください。 /cc-home/_global_/config/condaこのトピックの手順を実行すると、にファイルが .condarc 作成されます。 たとえば、次のような形 .condarc になるでしょう:

    channel_alias: <ip address>/api/repo
    channels:
        - myDataScience
    default_channels:
        - <ip address>/api/repo/myDataScience
    
  2. プロジェクトから「 RStudio 」を起動し、「Terminal」タブをクリックします。

  3. ファイルが .condarc 読み込まれていることを確認してください。 以下にアクセス:

    conda info
    

    回答例:

         active environment : R-4.2-rt23.1
        active env location : /opt/conda/envs/R-4.2-rt23.1
                shell level : 1
           user config file : /home/wsuser/.condarc
     populated config files : /opt/conda/.condarc
                              /opt/conda/envs/R-4.2-rt23.1/.condarc
              conda version : 23.7.2
        conda-build version : not installed
             python version : 3.10.13.final.0
           virtual packages : __archspec=1=x86_64
                              __glibc=2.28=0
                              __linux=5.14.0=0
                              __unix=0=0
           base environment : /opt/conda  (writable)
          conda av data dir : /opt/conda/etc/conda
      conda av metadata url : None
               channel URLs : <ip address>/api/repo/myDataScience/linux-64
                              <ip address>/api/repo/myDataScience/noarch
              package cache : /opt/conda/pkgs
                              /home/wsuser/.conda/pkgs
           envs directories : /opt/conda/envs
                              /home/wsuser/.conda/envs
                   platform : linux-64
                 user-agent : conda/23.7.2 requests/2.31.0 CPython/3.10.13 Linux/5.14.0-284.25.1.el9_2.x86_64 rhel/8.8 glibc/2.28
                    UID:GID : 1000770000:103000
                 netrc file : None
               offline mode : False
    
  4. RスクリプトファイルまたはRコンソールからパッケージをインストールできるようになりました:

    system('conda info')
    system('conda install <conda-packages>')
    

    たとえば、パッケージを assertthat インストールするには、次のように入力します:

    system('conda install r-assertthat')
    
  5. Packages 」タブをクリックし、インストールしたパッケージを検索して、コンソールからRパッケージを読み込めることを確認してください。 パッケージが見つかり、一覧に表示された場合は、インストールが正常に完了しています。