Egy Java program indításának legegyszerűbb módja az, hogy egy Java alkalmazás indítási konfigurációval futtatja. Ez a fajta indítási konfiguráció a munkaterület beállításaiból és a program Java projektjéből származtatott információkat használ a program indításához.
A fordítási egység vagy az osztályfájl kiválasztása helyett egy projekt kiválasztásával is elindíthat Java alkalmazásokat. Ki kell választania egy osztályt a main metódust meghatározó osztályok közül. (Ha a projektben csak egy főmetódussal rendelkező osztály van, akkor az indul el, mintha kiválasztotta volna.)

Java nézetek
Java szerkesztő
Hibakereső

Csatlakozás távoli
VM-hez a Távoli Java alkalmazás indítási konfigurációval
Program újraindítása
Futtatás és hibakeresés
Futtatási argumentumok beállítása
Program végrehajtásának
léptetése