A két fájl közötti különbségeket megjelenítheti a fájlok összehasonlításával. Összehasonlíthatja a különböző fájlokat, a munkaterületen lévő verziókat a lerakatban lévő verziókkal, vagy a fájlokat a fájlok helyi szerkesztés történetével. Egyes esetekben három fájlt is összehasonlíthat (ha a fájloknak van közös elődjük).
Az összehasonlítás elvégzése után egy összehasonlító szerkesztő jelenik meg a szerkesztő területen. Az összehasonlító szerkesztőben végignézheti a különbségeket, és a kijelölt különbségeket átmásolhatja az összehasonlított erőforrások között. Lehetősége van az erőforrásokon az összehasonlító szerkesztőben elvégzett módosítások mentésére is.
Az Összehasonlító szerkesztő kétféle navigációt tesz lehetővé: különbségek vagy módosítások használata. A módosítás a szöveg része, amely a sorban módosítva lett, és a különbség a fájl egy része, amely legalább egy sorból áll és számos módosítást tartalmaz.
A különbségek kék színnel vannak jelölve, a módosítások vörössel.
Az összehasonlító szerkesztő így néz ki, ha egy CVS munkaterület szinkronizálásból nyitja meg.
Az Összehasonlító szerkesztő eszköztára az alábbi gombokat tartalmazza:











Szinkronizálás CVS lerakattal
Háromutas összehasonlítások
Erőforrások összehasonlítása
Szinkronizálás a lerakattal
Módosítások összefésülése az összehasonlító szerkesztőben
Ütközések feloldása
Fájlösszehasonlítások beállításainak megadása
Erőforrások összehasonlítása a lerakat verziókkal