-yaml

Catégories

Propriétés

Syntaxe

bsub -yaml nom_fichier

Options en conflit

Ne l'utilisez pas avec les options suivantes: -json, -jsdl, -jsdl_strict.

Descriptif

Dans le fichier YAML, spécifiez le nom ou l'alias de l'option bsub et la valeur en tant que paire clé-valeur. Pour spécifier une commande de travail ou un script de travail, utilisez le nom de l'option command avec le nom de la commande ou du script de travail comme valeur. Pour les options qui n'ont pas de valeurs (indicateurs), utilisez null ou (pour les options de type chaîne) une valeur vide. Indiquez les paires clé-valeur sous le nom de catégorie de l'option.

Si vous spécifiez des paramètres de soumission de travail en double ou en conflit, LSF résout le conflit en appliquant les règles suivantes:

Les paramètres spécifiés dans la ligne de commande remplacent tous les autres paramètres.
Les paramètres spécifiés dans le fichier YAML remplacent le script de travail.

Options de soumission de travail et alias

Vous trouverez ci-après la liste des options bsub à utiliser dans le fichier. Vous pouvez utiliser le nom d'option sans trait d'union ou l'alias. Par exemple, pour utiliser l'option bsub -app , spécifiez appName ou app comme nom de clé et le nom de profil d'application comme valeur de clé.

Tableau 1. Liste des options de commande bsub prises en charge, des alias, de la catégorie, du type et de la taille maximale par caractères
Option	Alias	Catégorie	Tapez	Nombre maximal de caractères
a	appSpecific	planning	Chaîne	16415
drapeaux d'allocation	allocFlags	ressource	Chaîne	Non applicable
Application	appName	Propriétés	Chaîne	59
Ar	autoResize	Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
B	notifyJobDispatch	avertir	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
b	specifiedStartTime	planning	Chaîne	16
C	coreLimit	limite	Numérique	Non applicable
c	cpuTimeLimit	limite	Chaîne	63 pour les noms d'hôte (c'est-à-dire, si un nom d'hôte est spécifié dans le cadre de la limite, le nom d'hôte est limité à 63 caractères)
clusters de serveurs	clusters de serveurs	ressource planning	Chaîne	39 par cluster
cn_cu	computeNodeComputeUnit	ressource	Chaîne	Non applicable
cn_mem	computeNodeMem	ressource	Numérique	Non applicable
isolement_corec	coreIsolation	ressource	Numérique	Non applicable
csm	csm	Propriétés	Chaîne	1 (accepte `y`ou `y`)
CWD	CWD	:NONE.	Chaîne	4095
D	dataLimit	limite	Numérique	Non applicable
données	données	ressource Propriétés	Tableau de chaînes	Jusqu'à 4095 pour les chemins d'accès, ou une valeur inférieure ou égale à la valeur NI_MAXHOST (définie dans les fichiers d'en-tête système) moins un) pour les hôtes
Datachk	dataCheck	ressource Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
grp de données	dataGroup	ressource Propriétés	Chaîne	Non applicable
E	preExecCmd	Propriétés	Chaîne	4095
Ep	postExecCmd	Propriétés	Chaîne	4095
e	errorAppendFile	:NONE.	Chaîne	4095
env	envVariable	Propriétés	Chaîne	4095
eo	errorOverwriteFile	:NONE.	Chaîne	4095
eptl	epLimitRemain	limite	Chaîne	511
poste	extSched	planning	Chaîne	1048575
F	fileLimit	limite	Numérique	Non applicable
f	Fichier	:NONE.	Chaîne	4095
fréq	fréquence	ressource	Numérique	Non applicable
G	userGroup	planning	Chaîne	511
g	jobGroupName	Propriétés	Chaîne	511
gpu	gpu	ressource	Chaîne	768 pour chaque paire clé-valeur
H	mise en attente	planning	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
hl	hostLimit	limite	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
fichier hôte	hostFile	ressource	Chaîne	4095
I	interactif	Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
Adresse IP	interactivePty	Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
support IBM	interactiveSsh	Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
Fournisseur d'accès Internet	interactiveSshPty	Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
Systèmes d'informations	interactiveSshPtyShell	Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
Désigne	interactivePtyShell	Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
IX	interactiveXWin	Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
i	inputFile	:NONE.	Chaîne	4095
est	inputHandleFile	:NONE.	Chaîne	4095
J	jobName	Propriétés	Chaîne	4095
jd	jobDescription	Propriétés	Chaîne	4095
jsm	jobStepManager	Propriétés	Chaîne	1 (accepte `y`, `y`ou `d`)
K	jobWaitDone	avertir Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
k	checkPoint	Propriétés	Chaîne	4095
L	loginShell	Propriétés	Chaîne	58 (limite du système d'exploitation)
LP	licenseProjectName	planning	Chaîne	2047
ln_mém	launchNodeMem	ressource	Numérique	Non applicable
ln_attributs	launchNodeSlots	ressource	Numérique	Non applicable
M	memLimit	limite	Chaîne	Non applicable
m	Machines	ressource	Chaîne	65 par hôte
mig	migThreshold	planning	Numérique	Non applicable
N	notifyJobDone	avertir	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
Grou	notifyJobExit	avertir	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
n	numTasks	ressource	Chaîne	Non applicable
avertir	notifyJobAny	avertir	Chaîne	25
réseau	networkReq	ressource	Chaîne	768 pour chaque paire clé-valeur
nnodes	numNodes	ressource	Numérique	Non applicable
o	outputAppendFile	:NONE.	Chaîne	4095
Oo	outputOverwriteFile	:NONE.	Chaîne	4095
répertoire de sortie	outputDir	:NONE.	Chaîne	4095
P	projectName	Propriétés	Chaîne	511ho
p	processLimit	limite	Chaîne	Non applicable
comprimer	comprimer	comprimer	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
ptl	pendTimeLimit	limite	Chaîne	511
Q	exitCode	Propriétés	Chaîne	511
q	queueName	Propriétés	Chaîne	59 pour chaque file d'attente
R	resReq	ressource	Tableau de chaînes	Non applicable
r	réexécuter	Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
RN	rerunNever	Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
Rnc	resizeNotifCmd	Propriétés	Chaîne	4095
S	stackLimit	limite	Numérique	Non applicable
s	signal	Propriétés	Numérique	Non applicable
sla	serviceClassName	Propriétés	Chaîne	59
smt	smt	Propriétés	Numérique	Non applicable
sp	jobPriority	Propriétés	Numérique	Non applicable
étape	étape	Propriétés	Chaîne	4095
groupe_étapes	stepCgroup	Propriétés	Chaîne	1 (accepte `y`ou `n`)
T	threadLimit	limite	Numérique	Non applicable
t	specifiedTerminateTime	planning	Chaîne	16
ti	terminateIndepend	planning	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
unité tty	unité tty	:NONE.	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
U	rsvId	planning ressource	Chaîne	59
u	mailUser	avertir	Chaîne	511
ul	userLimit	limite	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
v	swapLimit	limite	Chaîne	Non applicable
W	runtimeLimit	limite	Chaîne	64 pour les modèles hôte (définis dans lsf.shared dans la section `HostModel`)
Me	estimatedRunTime	limite	Chaîne	64 pour les modèles hôte (définis dans lsf.shared dans la section `HostModel`)
w	dépendance	planning	Chaîne	Non applicable
wa	warningAction	Propriétés	Chaîne	6
wt	warningTime	Propriétés	Chaîne	Non applicable
XF	x11Forward	Propriétés	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
x	exclusif	planning	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
Zs	jobSpool	Propriétés script	Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
h	aide		Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
V	version		Chaîne	0 (ne prend aucun argument)
commande La commande de travail avec des arguments ou un script de travail.	CMD		Chaîne	64 000 (longueur maximale d'une ligne dans le fichier de soumission de travail)

Pour plus d'informations sur la syntaxe des valeurs de clé à spécifier pour chaque option, voir la description de chaque option bsub dans bsub.

Exemple

Pour la commande de soumission de travail suivante:

bsub -r -H -N -Ne -i /tmp/input/jobfile.sh -outdir /tmp/output -C 5 -c 2022:12:12 -cn_mem 256 -hostfile /tmp/myHostFile.txt -q normal -G myUserGroup -u "user@example.com" myjob

Le fichier YAML suivant spécifie la commande de soumission de travail équivalente:

io: 
    inputFile: /tmp/input/jobfile.sh
    outputDir: /tmp/output
limit: 
    coreLimit: 5
    cpuTimeLimit: 2022:12:12
resource: 
    computeNodeMem: 256
    hostFile: /tmp/myHostFile.txt
properties:
    queueName: normal
    rerun: null
schedule: 
    hold: ""
    userGroup: myUserGroup
notify: 
    notifyJobDone: ""
    notifyJobExit: 
    mailUser: user@example.com
command: myjob