Utilización de libs desde el repositorio de Anaconda

Puede utilizar paquetes de software y bibliotecas de Anaconda Repository for IBM Cloud Pak for Data en RStudio.

Servicio Anaconda Repository for IBM Cloud Pak for Data no está disponible de forma predeterminada. Este servicio debe instalarlo un administrador.

Para utilizar paquetes y bibliotecas del repositorio Anaconda en RStudio :

  1. condaCrear canales, duplicar paquetes y configurar. Consulte «Configuración de conda y creación de canales »... Los pasos de este tema crearán un .condarc archivo en /cc-home/_global_/config/conda. Por ejemplo, el .condarc podría tener el siguiente aspecto:

    channel_alias: <ip address>/api/repo
    channels:
        - myDataScience
    default_channels:
        - <ip address>/api/repo/myDataScience
    
  2. Inicie RStudio desde su proyecto y haga clic en la pestaña Terminal.

  3. Verifique que el archivo .condarc está cargado. Especifique:

    conda info
    

    Ejemplo de la respuesta:

         active environment : R-4.2-rt23.1
        active env location : /opt/conda/envs/R-4.2-rt23.1
                shell level : 1
           user config file : /home/wsuser/.condarc
     populated config files : /opt/conda/.condarc
                              /opt/conda/envs/R-4.2-rt23.1/.condarc
              conda version : 23.7.2
        conda-build version : not installed
             python version : 3.10.13.final.0
           virtual packages : __archspec=1=x86_64
                              __glibc=2.28=0
                              __linux=5.14.0=0
                              __unix=0=0
           base environment : /opt/conda  (writable)
          conda av data dir : /opt/conda/etc/conda
      conda av metadata url : None
               channel URLs : <ip address>/api/repo/myDataScience/linux-64
                              <ip address>/api/repo/myDataScience/noarch
              package cache : /opt/conda/pkgs
                              /home/wsuser/.conda/pkgs
           envs directories : /opt/conda/envs
                              /home/wsuser/.conda/envs
                   platform : linux-64
                 user-agent : conda/23.7.2 requests/2.31.0 CPython/3.10.13 Linux/5.14.0-284.25.1.el9_2.x86_64 rhel/8.8 glibc/2.28
                    UID:GID : 1000770000:103000
                 netrc file : None
               offline mode : False
    
  4. Ahora puede instalar paquetes desde un archivo de script R o la consola R:

    system('conda info')
    system('conda install <conda-packages>')
    

    Por ejemplo, para instalar el paquete assertthat , entre:

    system('conda install r-assertthat')
    
  5. Verifique que puede cargar los paquetes R desde la consola haciendo clic en el Paquetes y buscando los paquetes que instaló. Si los paquetes se encuentran y se listan, se han instalado correctamente.